Mnohem déle se udržoval pouze v Beskydech, ve východní části země u polsko-slovenské hranice. Od začátku 70. let byl pozorován pomalý návrat medvědů k tomuto terénu. Početnost populace, která osídlila Moravskoslezské Beskydy je odhadována na pouhé 1-3 jedince. (Kaczensky a jiní 2013).

Medvěd hnědý se v České republice v současnosti vyskytuje jen v karpatské části území, tedy v horských celcích Moravskoslezské Beskydy, Slezské Beskydy, Vsetínské vrchy a Bílé Karpaty. Ojedinělé záznamy pocházejí také z podhůří nebo nížin, navazující na tyto horské celky. Počet medvědů v Beskydech není stálý a medvědi zde zřejmě nezimují, ani zde nebylo prokázáno rozmnožování (Bojda et al., 2014).